Vierzehn Jahre sind nach dem Second Impact vergangen doch die Menschheit wird immer noch von
den Engeln attackiert. Shinji Ikari wird aus Evangelion Einheit-01 geborgen und erkennt dass
sich Dinge geändert haben jedoch nicht zum Besseren: Die Welt wurde verwüstet und seine
ehemals Verbündeten von NERV haben sich ihm und Rei Ayanami gegenüber feindlich eingestellt.
Obwohl Shinji für Rei alles riskiert hatte konnte sie bislang nicht in Eva Einheit 01 wieder
gefunden werden. Shinji versucht sich an die neue Umgebung anzupassen und trifft dabei auf den
rätselhaften Kaworu Nagisa. Beide begeben sich auf die Suche nach Rei und stoßen dabei auf
schreckliche Wahrheiten ...
