Da die US-japanische Anti-Terror-Organisation CIRS öffentlich bekannt geworden ist wird eine
neue Agentur für verdeckte Missionen ausgegliedert: SORD (Social Ops Research and
Development). Das Ziel ist es eine neue Generation von Agenten auszubilden die das Land gegen
zukünftige Bedrohungen verteidigen sollen. Zu diesem Zweck hat die Organisation eine Reihe von
Schulen im ganzen Land eingerichtet. Auch die Mihama-Akademie gehört dazu und ist nun die
Heimat einer Gruppe von Schülern die jeden Tag daran arbeiten ihre einzigartigen Fähigkeiten
zu verbessern. Hier werden soziale Außenseiter meist junge Mädchen trainiert und
unterrichtet. Das Team um Haruto stürzt sich immer wieder in gefährliche Missionen - alles zum
Wohle des Landes das sie verstoßen hat.