Giratina ist das einzige Pokémon das in der Gegenwelt lebt einem unbekannten Nachbarbereich
unserer Welt. Voller Wut über Palkias und Dialgas Störung von Raum und Zeit zerrt es Dialga in
die Gegenwelt um mit ihm zu kämpfen. Aber der Konflikt wird vom winzigen Shaymin dem
Dankbarkeits-Pokémon beigelegt! Nachdem Shaymin die Gegenwelt verlassen und Ash und dessen
Freunde getroffen hat bittet Shaymin telepathisch um Hilfe denn es möchte mit den anderen
Shaymin im Blumengarten zusammen sein. Kurz nachdem Ash und seine Freunde zugestimmt haben
Shaymin zu helfen werden sie in die Gegenwelt entführt und treffen dort auf Professor Newton
der dieses geheimnisvolle Reich erforscht. Sie ahnen nicht dass Newtons ehemaliger Assistent
Zero die Macht von Giratina nutzen will um sich zum Herrscher der Gegenwelt aufzuschwingen
selbst wenn er dazu die echte Welt zerstören muss!