Natsume kann seit seiner frühester Kindheit Yokai (Geisterwesen) sehen. Durch diese besondere
Gabe ist Natsume jedoch in der Gesellschaft zu einem Außenseiter geworden wodurch er auch den
Yokai selbst eher zurückhaltend gegenübersteht. Eines Tages erbt er von seiner Großmutter Reiko
das »Buch der Freunde« in dem die Namen aller Yokai verzeichnet sind mit denen diese einen
Pakt geschlossen hatte. Ab diesem Zeitpunkt wird Natsume in viele aufregende Abenteuer
verwickelt da die meisten Yokai sehr großes Interesse an diesem Buch haben und mit allen
Mitteln versuchen in dessen Besitz zu gelangen. Allen voran Nyanko-sensei ein Geist in
Katzenform der von Natsume von einem Bann befreit wurde