Lernen Sie grundlegende Java-Techniken die für die Auswertung von Biodaten benötigt werden
Eine Einführung in Java für Biowissenschaftler mit Programmiererfahrung Bietet biologische
Hintergrundinformationen soweit sie zum Verständnis des Problems hilfreich sind Mit
zahlreichen Übungsaufgaben und Codebeispielen Diese Einführung in die angewandte Bioinformatik
mit Java vermittelt Ihnen grundlegende Java-Techniken die für die Analyse von Daten in den
Life Sciences benötigt werden. Das Buch richtet sich an Studenten Wissenschaftler und
Praktiker mit Grundkenntnissen in einer höheren Programmiersprache. Es bietet Ihnen einen
fundierten Einstieg in die Kernthemen der Programmierung in den Life Sciences. Aussagekräftige
Beispiele aus der Bioinformatik illustrieren alle notwendigen Schritte damit Sie in kurzer
Zeit Ergebnisse mit Java erzielen können. Biologische Zusammenhänge werden immer dann
beschrieben wenn sie zum Verständnis des Problems hilfreich sind. Anhand der zahlreichen
Praxisprojekte und Übungsaufgaben lernen Sie Ihre eigenen gut durchdachten Softwarelösungen
zu schreiben. Themen des Buchs: Die Java-Arbeitsumgebung: Installation und Einrichten von JDK
Eclipse Git und Maven Java zum Auffrischen: Programmierkonzepte wie Variablen Arrays und
Schleifen sowie objektorientiertes Programmieren Data Engineering: Workflows für den Data
Lifecycle die Arbeit mit XML JSON SQL API-Schnittstellen und BASH Data Mining: Methoden der
Klassifizierung und des Clusterings wie Binning Hashing statistische Modelle und K-Means
Netzwerkanalyse: Einführung in die Bibliothek JGraphT Graphen als Methode zur Darstellung
biologischer Prozesse Bildverarbeitung: die Arbeit mit ImageJ für Partikelanalyse
Objektklassifizierung und Farbanalyse Sequenzanalyse: die Bibliothek BioJava Sequence
Alignment BLAST und Next-Generation Sequencing
