Der Bourne-Skandal hat massiven Wirbel verursacht deshalb ist die CIA gezwungen die Operation
Outcome – das Nachfolge-Programm der Jason-Bourne-Operation - fürs Erste auf Eis zu legen.
Aaron Cross (Jeremy Renner) ist einer der Agenten aus der Outcome-Abteilung. Er wacht in
Isolationshaft auf nur um festzustellen dass er genau wie der Rest der Abteilung eliminiert
werden soll. Die attraktive Ärztin Dr. Marta Shearing (Rachel Weisz) hat an der Verbesserung
der Agenten mitgearbeitet und ist schockiert über die Entscheidung dass so viele Menschen
getötet werden sollen. Also beschließt sie Cross bei der Befreiung aller Operation Outcome
-Agenten zu helfen. Auf ihren Fersen ist CIA-Agent Byer (Edward Norton) der das Duo unter
allen Umständen stoppen muss da sonst die komplette Integrität seiner Firma in Frage steht.